Misioni i Departamentit të Fizikës dhe Shkencave të Aplikuara luhatet nga ofrimi i një niveli të përparuar mësimdhënie në fushat e studimit që stafi akademik i këtij departamenti mbulon e deri në kërkim shkencor, me qëllim për të përgatitur specialistë të aftë të nivelit Bachelor, Master Profesional dhe Master Shkencor në mënyrë që të kenë mundësi të punësohen në sistemin akademik, bujqësi, pylltari, industri dhe agjenci të ndryshme publike dhe private. Stafi akademik i këtij departamenti është i angazhuar në programe studimore të ndryshme që zhvillohen në të gjitha Fakultetet e Universitetit Bujqësor të Tiranës.